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Plus de 15 criblages du génome de familles de strutures différentes, atteintes de psoriasis, ont été réalisés. Parmi les nombreuses régions candidates décrites, seul le locus HLA a été confirmé de manière significative dans diverses études. Cette discordance entre les études, réalisées sur différentes populations, a conduit notre équipe à s'intéresser à la prédisposition génétique au psoriasis dans la population française, en particulier dans des grandes familles. De nombreux paramètres peuvent expliquer l'absence de réplication parmi ces études. Par exemple, la puissance de détection peut être diminuée par l'hétérogénéité génétique et phénotypique de la maladie, par un faible effet génétique des gènes à identifier, et par la petite taille des échantillons testés, souvent non suffisante pour détecter des gènes à effet faible ou modéré. Or, la plupart des études ont été réalisées sur des échantillons de structure et de taille très variables, pouvant expliquer ce défaut de réplication. Dans notre première étude, le premier criblage décrit précédemment a été réalisé tout d'abord sur 14 grandes familles françaises atteintes de psoriasis, s'étendant parfois sur 3 générations. L'utilisation de grandes familles permet de
Table 3.1:
Résumé des résultats les plus significatifs (Z>2) de l'analyse de liaison paramétrique réalisé sur la totalité des marqueurs (Criblage 1+2) sur les 46 familles françaises par MLINK
Chr. |
Marqueurs |
Position (cM) |
Modèle |
Z() max |
|
|
D6S1615 |
44.96 |
|
3.15 |
0.3 |
|
D6S1560 |
47.71 |
|
|
D6S1583 |
47.71 |
|
|
D6S1629 |
47.71 |
|
|
D6S1542 |
47.71 |
|
|
D6S1568 |
47.71 |
|
|
D6S1618 |
47.71 |
|
|
D6S1701 |
47.71 |
|
|
D6S1611 |
47.71 |
|
|
D6S439 |
48.26 |
|
7p14 |
D7S510 |
59.93 |
dominant |
2.11 |
0.3 |
18p11 |
D18S1132 |
11.21 |
dominant |
2.76 |
0.2 |
20p13 |
D20S116 |
11.20 |
dominant |
2.06 |
0.3 |
22q13 |
D22S423 |
46.42 |
récessif |
2.49 |
0.3 |
limiter, au sein d'une famille, l'hétérogénéité génétique puisqu'il est plus probable que peu de facteurs génétiques ségrégent dans chaque famille et que les allèles correspondants soient les mêmes pour tous les patients de la famille. En contrepartie, ce choix ne permet pas de détecter tous les loci de prédisposition au psoriasis. De plus, dans ces grandes familles, il est observé un mode de transmission mendélien de type autosomique dominant, pouvant être le reflet de la transmission d'un gène majeur. L'étude de ces familles a permis l'identification de six régions dont cinq d'entre elles (6p21, 10q, 13q, 14q et 20p13) déjà détectées dans au moins une autre étude [Nair et al., 1997,Trembath et al., 1997,Veal et al., 2001,Sagoo et al., 2004]. Ces loci ont été analysés dans 32 autres grandes familles, sur lesquelles le criblage du génome entier n'avait pas été réalisé. Ceci a permis de confirmer les régions 6p21 et 20p13.
Afin de rechercher d'autres régions candidates, un deuxième criblage avec une couverture plus dense du génome (370 microsatellites, environ 1 tous les 10 cM) a été réalisé sur l'ensemble des 46 familles au CNG (nommé par la suite "Criblage 2").
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2009-08-22