Principe

Le principe du génotypage des microsatellites est d'amplifier, par la technique de PCR (Polymerase Chain Reaction), spécifiquement un fragment d'ADN comportant le marqueur microsatellite encadré par deux séquences connues utilisées comme amorces, puis de séparer les différentes tailles des amplifiats, correspondant aux divers profils alléliques de ce marqueur, par électrophorèse sur un gel d'acrylamide. Le séquenceur intègre les différentes émissions de fluorescence émises par l'excitation par un laser des fluorochromes, marquant les différents microsatellites en 5'P et, à l'aide de logiciels, va permettre de distinguer les différents marqueurs par leurs marquages et les allèles par leur taille, estimée en fonction des différents pics du marqueur de taille.