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Premier criblage du génome (nommé "Criblage 1")

Le premier criblage de l'ensemble du génome, réalisé au laboratoire, a été entrepris en génotypant et en analysant un panel de 260 marqueurs microsatellites polymorphiques, choisis en fonction de la carte génétique de Généthon (Evry, France), sur un premier groupe de 14 familles du Lot I. Des marqueurs supplémentaires à ce panel dans des loci candidats précédemment publiés ont également été analysés (Tableau 2.2Microsatellites supplémentaires génotypés dans les 14 premières familles du Lot I ou dans la totalité des 46 familles du même lot).
Ces marqueurs sont le plus souvent des marqueurs de répétitions de dinucléotides (CA), répartis de manière régulière (environ un marqueur tous les 15 cM) et abondamment tout au long du génome. Lorsqu'une liaison entre une région et le psoriasis a été suggérée dans ce premier groupe de 14 familles, la région a été étudiée dans le deuxième groupe des familles du lot I (32 familles restantes).


Table 2.2: Microsatellites supplémentaires génotypés dans les 14 premières familles du Lot I ou dans la totalité des 46 familles du même lot (6p, 10q, 13q, 14q, 16p and 20p)


Région & Marqueurs & Hétérozygotie & 3cmDistance du telomere (P) (cM)& Référence


\begin{supertabular}{lcccc}
\par
\multirow{3}{2cm}{1p12-p13 (PSORS7)}&D1S2726&0....
...&0.81&25&\\
&D20S189&0.75&31&\\
&D20S112&0.80&39&\\
\hline
\end{supertabular}

Ainsi, 2 à 8 marqueurs adjacents ont été analysés à l'exception de la région 6p21 (13 marqueurs) et de la région 8q24 (9 marqueurs) dans 32 autres familles (Tableau 2.2Microsatellites supplémentaires génotypés dans les 14 premières familles du Lot I ou dans la totalité des 46 familles du même lot).


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anouar 2009-08-22